
2024年9月由合肥种植业大学本科张万刚教导技术团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物制品为该研究提供了亚硝基化突显组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
繁体中文关键词:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年影向分子:5.7
刊登时间间隔:2024年9月
客服方:南京农业大学
科学研究相关材料:蛋白
拜谱展示 技术应用:亚硝基化修饰组学
能力自驾路线:
一、钻研可是
01.Caspase-3活性酶类
日前尚不清理NO对caspase-3的调控反应要不要归因于NO介导的S-亚硝基化,不一样渗透压均值的GSNO看作外源性NO产生,以引导caspase-3的身体之外S-亚硝基化。报告单证实,与如果没有GSNO的组相对于,100、200和400μM GSNO组的caspase-3可溶性有效下降(图1),与之前报导不一。GSNO外理下降caspase-3可溶性的暗藏原由仍有待于阐释。
图1 各不相同渗透压的GSNO加工处理对caspase-3抗逆性的影响力
02.Caspase-3的S-亚硝基化程度上
理论钻研Caspase-3的亚硝基化因素,以体现了GSNO对Caspase-3的反响性。经GSNO治理后,检则到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化抗弯强度增大(图2)。这报告取决于,外源性GSNO培育可非常成功诱导型caspase-3的身体外S-亚硝基化。让人觉得惊喜的是,在没GSNO存在的的比较组中检则到另一个衰弱的S-亚硝基化带,这取决于caspase-3很有可能再次发生内源性的S-亚硝基化。前者,本理论钻研中caspase-3的S-亚硝基化因素较高,而caspase-3的活力大大减少,这与在之前的理论钻研同步。但是,caspase-3的特男人S-亚硝基化表达位点尚不很明白,还必须要进1步的宇宙探索。
图2 GSNO清理对caspase-3S-亚硝基化平均水平的反应
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化体现组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的队列。黄色标注的队列标识S-亚硝基化肽,粉红色标注的C标识S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3分解结蛋白质
结蛋清成为一类至关注重的组织细胞核骨架蛋清,在维护肌组织细胞核组成特征的组成特征齐全性和收拢性地方起着至关注重用途,研究方案S-亚硝基化caspase-3对结蛋清可可降解的神经敏理性还有着至关注重积极意义。与Std(未用胱天蛋清酶-3和GSNO孵育的刚开始肌植物纤维材料蛋清)组相对比,0 μM GSNO组(肌原植物纤维材料和caspase-3的孵育,无GSNO)的齐全结蛋清含锌量正相关变低,建议caspase-3对结蛋清还有着存在的蛋清淀粉水解技能。在GSNO孵育后,齐全结蛋清的含锌量显著增大(P < 0.05)。除此之外,当GSNO渗透压提升时,齐全结蛋清的含锌量长期调整(P < 0.05)(图5)。这类出现阐明,SNO绘制的caspase-3以技术水平依赖于的方案压制结蛋清的可可降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3光降解结淀粉酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙血清-T
肌钙核核淀粉酶质-T (TnT)是原肌球核核淀粉酶质调接责任腿部肌肉做收缩的细条的一定要肌原钎维核核淀粉酶质。TnT的溶解特殊性是论文检查到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化条件下,caspase-3对TnT的溶解事情如图如图是6如图是,与Std组(不包含caspase-3和GSNO的肌原钎维)相比之下,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写重要增长,反映出caspase-3陆续参与了TnT的溶解,虽然,caspase-3与GSNO的孵育导至30 kDa TnT的减低。在100和200 μM GSNO组相互间如果没有论文检查到比较突出的区别(P > 0.05),而当GSNO的氨水浓度可达到400 μM 时,该细节描写重要下降(P < 0.05)。以下会发现反映出了SNO表达的caspase-3对TnT溶解的限建设用。结核核淀粉酶质和TnT是caspase-3的脆弱底物,而GSNO解决减低caspase-3的几丁质酶或者导至肌原钎维核核淀粉酶质溶解程度减低。上述情况根据上述,NO帮助的S-亚硝基化是可以能够表达半胱氨酸残基来调接caspase-3的几丁质酶,以致进两步损害其对结核核淀粉酶质和TnT的核核淀粉酶质溶解程度,可以损害牛羊肉口感。
图6. S-亚硝基化caspase- 3光降解肌钙球蛋白-T
二、总结ppt
本论述此次论述S-亚硝基化对caspase-3装饰的会后果简述随即对牛羊肉肌原化学纤维棉离体生物降解的会后果。蛋清S-亚硝基化是可以装饰caspase-3的半胱氨酸残基,然后从而导致caspase-3特异性拉低,进一大步调控了其对牛羊肉肌原化学纤维棉蛋清的蛋清蛋白质水解特性。三、拜谱总结ppt
科学深入分析选取了酶活法测定,亚硝基化绘制组学浅析,WB等检查测量的手段,得知蛋清S-亚硝基化不错绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这引发了caspase-3吸附性的减低,并举一部能够抑制了其对羊肉肌原人造纤维蛋清的蛋清淀粉酶质水解能力素质。本科学深入分析为定义蛋清质亚硝基化对肉嫩的自我调节机制化供应半个个新的画面。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的核胆固醇组学、绘制核胆固醇组学、代谢率组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系例软件,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺碱化、total脱色复原、徘徊巯基,欢迎大家咨询!
规范期刊论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663