在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

钻研没想到

1、从光敏陪养血细胞中获取DNA热塑淀粉酶质

为了更好地抽滤分离光交连胆固醇质-DNA结合物使用在LC-MS浅析，我们开拓半个种男变女纯化方案设计，可从DNA中去必须交连胆固醇质，仅在影响时用直接的印染体组交往丰度DNA交连胆固醇质。用TRIZOL提炼印染质并剔除落网获的非交连胆固醇，但是将其二次溶解完以开始RNase助消化不良。用超声波裁切应纳税所得额胆固醇质交连DNA的提炼物，在硫氰酸胍中蒸煮男变女，并在二氧化的硅抽滤柱上的剧烈干洗以去必须交连胆固醇质就此顺利完成。用核酸酶补救从DNA中释放出来光交连胆固醇，并开始胰胆固醇酶助消化不良使用在LC-MS浅析。该的办法命名规则为胆固醇质交连DNA提炼或XDNAX。

图1.蛋清质化学交联DNA转化成或XDNAX步骤步骤（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可随时学习DNA的胆固醇质图谱

将光交连的方式选用于MCF7人体细胞膜，察觉到了1,805种备选淀粉酶，之中1,191种存在的于3个或许多次多次中。60%的DNA彼此目的组拥有核酸依照的GO标注，在较弱核酸依照标注的淀粉酶质中，最大的的贡献度原于核纤层淀粉酶，接下来是参于刺绣质进行和人体细胞膜分化的淀粉酶质（图2）。

图2 . 可单独沾染 DNA 的核脂肪酸（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3汇总了了DNA能够 目的组所潜在的淀粉酶质-DNA介面试述收录的核苷酸热塑肽。这收录犹豫（1）球状DNA联系节构域、（2）DNA 联系无章区（IDR）和（3）犹豫与某个淀粉酶质（举例子组淀粉酶联系淀粉酶）、RNA（举例子剪接因素）或相转移区室（举例子核仁淀粉酶）能够 目的而致使的情况相似。

图3 . 可可以直接相处 DNA的形式域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、降钙素原检测上皮细胞扰动这段时间与DNA配合的转录要素

雌荷尔蒙多巴胺受体α（ESR1）驻回到胞质溶胶中，是直到问题其配体，开启易位到癌受损細胞，在这里它与基因遗传组中的其他区域划分结合在一起以启用其他的转录程序流程。将血清饥饿的MCF7癌受损細胞外露于高分子量雌荷尔蒙（10 nM 17β-雌二醇）4两分种，与仿真治理 的相当癌受损細胞相当二者的DNA互不效用组（图4A）。在这当中，雌荷尔蒙畅快后DNA互不效用组中的ESR1扩大了30倍（图4B）。总的并不是，在1,814个按量的血清质-DNA互不效用中，约有9%凸显出高出2倍的显著性变化无常，并通过观察到与ESR1极具互不效用的血清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌抗生素除理甲状腺癌人体细胞 DNA 完美目的组的降钙素原检测比（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人总结

实验进dna组的蛋清质以了解一下它是如何才能被载入并付诸应用的，一支是科研开发成员个暂时的向往。dna组可及性通常以DNA为核心的维度确定实验，虽然，到近年 ，刺绣质妇科凝胶中的哪些方面蛋清质与DNA 挖掘机械相护用处尚不模糊。实用零间距光化学交联，可挖掘DNA相护用处组中的大部分数蛋清质，XDNAX工艺将看做蛋清质-DNA相护用处实验的强悍专用工具。

拜谱总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的球蛋白质含量组学、突显组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

分类文献资料：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.