代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
有效组分认定会：消化吸收组学技巧应用就就也能对中成药中的电学有效组分完成着力概述，认定会出药才中的灵活性酶有效组分。列如，用应用于质谱（MS）的消化吸收组学技巧应用，就也能认定会出人叁中的人叁皂苷等灵活性酶有效组分。这样技巧应用还就也能分别入药和非入药组成部分的电学标记图片物，为中成药的安全性能调节带来了理论依据。
服务效果管理：按照分解细胞代谢转化组学技术工艺，可不可对中成药的服务效果实现评估报告和管理。诸如，巧用苔藓植被分解细胞代谢转化组学介绍，可不可制作争对类风湿病性关节软骨炎的中成药化工材质的服务效果标志的一定量策略。除此以外，分解细胞代谢转化组学还可不可鉴别中成药中的渗透性化工材质还有渗透性制度化，如按照UPLC-Q-TOF-MS论述，划分差异乌头苔藓植被的化工化工材质，并鉴别还具有镇疼几丁质酶和亚急性渗透性的微生物碱。
2. 中药药效机制研究
功效靶点判别：排泄组学方法能益处判别中要活性酶类部分的分子结构靶点。诸如，设计表明雷公藤红素可能够 调理Treg/TH1和Treg/Th17动态平衡、阻绝NF-κB通道等规则发挥出来消除炎症功效。
用工作机理论述：分解分泌组学水平也能蕴含草药改善妇科疾病的用工作机理。比如，学习感觉青蒿素抗药性与疟原虫的线粒体分解分泌改动关与，非靶点分解分泌组学蕴含了与该方式有关的的分解分泌物波动。再者，分解分泌组学还不错依据浅析分解分泌物的波动，学习草药复方的用工作机理。
3. 中药安全性评价
渗透性考核管理机理探究：分泌组学技巧也可以在探究中成药的渗透性考核管理机理。诸如，完成分泌组学和16S rDNA测序的转型概述，蕴含了清益汤对危重症急慢性膀胱胰腺炎相关联急慢性膀胱肺破损的养护考核管理机理，并选定了铁镇定、之前的相互关系分泌物和微怪物菌群之前的相互关系。
健康安全管理的性分析：产生组学方法还就能够应用于西药才的健康安全管理的性分析，自动识别自身的毒素成份和毒素靶点，因此为西药才的健康安全管理的动用出具科学的按照。
4. 中医证候研究
证候各种相关联的消化吸收转化物概述：消化吸收转化组学技巧是可以广泛用于定量分析与中国传统医学证候各种相关联的的内源性消化吸收转化物变化无常，引导中国传统医学证候的检验和行为矫正。举例，经由消化吸收转化组学设计，已在冠相思病爱美者中签别出与痰瘀证和和气气阴两虚证各种相关联的的海洋生物标志图案物。
证候应对实验：排泄组学的技术应用还也可以采用实验成药对医学证候的应对效果好。列如，也可以 排泄组学的技术应用及聚类探讨法探讨法，看见“黄芪-茯苓-泽泻”等一些中成药选用适采用肾病总体征的新组方中成药，也可以对多种多样肾病总体征一些的生物学象征物产生影向。
5. 多组学技术整合应用
两组学结合：分解代谢组学与一些组学枝术（如基因遗传组学、转录组学、脂肪酸质组学等）的结合利用，为草药方设计展示 新一个多特点的定性分析三层架构。这样的结合利用不仅能变大了我对草药方部分在碳原子范畴上对体内生理上和病理学情况下的后果，可是为论述草药方的意义考核机制和药用价值杂质基本展示 了强至关重要的的机器。
病症制疗考核措施：多个学技术水平是可以适用于深入分析中药才制疗病症的团伙考核措施。列举，在淀粉酶质组学和分解组学的联动软件，揭露了与医学等级分类的膝依然能骨性依然能炎频繁相应的之间的关系表达方法淀粉酶和分解通道。
分解组学工艺在中草药学习中的应用，为中草药的如今化和靶向整形展示了首要的实验兼容，有助推进中草药的要求化和国际性化进展。