草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿程序最喜欢见的可以使肠胃疾病之三。肾结构中CaOx单晶体过达到饱和状态沉积物会致使肾小管细胞系直接损伤和凋亡，所以致使肾结石的变成。短链人体脂肪细胞酸由可以使肠胃内水解酸化池细茵发醇合理膳食纤维素板引起，不止在局部位可以使肠胃深层中展现反应，特别在程序标准上也展现关健反应。当中，丁酸是最非常丰富的短链人体脂肪细胞酸，都具有抗感染和免疫性仰制反应,本设计研究综述丁酸对CaOx肾结石的反应简述不确定性靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山机构泌尿急诊科吴忠传授、周子健博士后于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠专家教授、周子健硕士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物工程与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了数据网络药理学学服务于，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

论文英文名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 买家企事业单位：华山门诊 理论研究相亲对象：大鼠、HK-2细胞核 分组名新信息：较组（Con）、建模组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来了技術：网络数据临床药理学论文检测

基本思路程序图

的研究结论

研究方案方案相关人员第一个融合大鼠仿真三维模式，依据生理问题生化模式指数公式和聚集病理学学上色等研究方案方案技术手段发现了丁酸能能限制CaOx仿真三维模式大鼠肾CaOx多晶体的构成和断裂，改变CaOx仿真三维模式大鼠的真菌感染断裂和脱色产品的过量表达出来。除外，丁酸还可调节草酸介导的HK-2細胞断裂、脱色应激状态和細胞凋亡。 为探究性学习丁酸节构和靶遗传人类染色体遗传wifi网洛，理论研究人工从PubChem修改丁酸和丁酸酯的二维和3d节构（图1A）。依据PharmMapper数据表格信息库显示库和Uniprot数据表格信息库显示库处里后共选择出11七个丁酸靶遗传人类染色体遗传供进一点介绍。将遗传人类染色体遗传全部倒入STRING数据表格信息库显示库，来进行PPIwifi网洛介绍。Cytoscape根据了排列顺序的前20的交通核心区靶遗传人类染色体遗传的详解wifi网洛图，各类CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这一些交通核心区遗传人类染色体遗传与wifi网洛中的同一遗传人类染色体遗传均展现出肯定的一些性，就说明这一些遗传人类染色体遗传很有有机会利用出着联合目的。GO和KEGG介绍论述了丁酸交通核心区遗传人类染色体遗传的一些经由和怪物体学功能键（图1C）。交通核心区遗传人类染色体遗传比较为重要与类固醇生长荷尔蒙回话、阳极氧化的应激状态性回话、特异性氧氧生殖细胞对类固醇生长荷尔蒙的刺激的影响各类对呈酸性电化学材料的影响相关的英文。上述讲到提出的，这一些交通核心区遗传人类染色体遗传比较为重要加入了阳极氧化的应激状态性和对特异性氧氧的怪物体影响环节，是肾结石建成策略中至关比较为重要的经由，这是因为丁酸很有有机会在肾结石中利用出比较为重要目的。

图1| 丁酸组成部分与靶DNA线上解析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进第一步探险丁酸对CaOx肾结石不容置疑切靶表观遗传，探讨工作人数凭借GEO数据表格资料库对GSE73680中健康保健剖析与CaOx肾结石人群的表观遗传的差异采取了探讨。剖析组与CaOx结石人群的强势性的差异形容表观遗传（DEGs）产前筛查规格为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个表观遗传造成强势发展，在其中3379个（89.4%）表观遗传形容上涨，404个（10.6%）表观遗传形容降低（图2A）。对DEGs采取聚类算法探讨法探讨，热图显现了前10个被选中DEGs的二维逐层聚类算法探讨法显著特点（图2B）。然后，探讨工作人数按照GeneCards数据表格资料库手工鉴定费了370个很有可能与CaOx肾结石一些的表观遗传，排名榜前20位的預測表观遗传举例一些性评定如图已知2C已知。从而找自己丁酸诊治CaOx肾结石的关健靶点，探讨工作人数将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些表观遗传加工受到新一个Venn图。终极，CYP2C9被肯定为丁酸印象CaOx肾结石的潜在性的靶点(图2D)。凡此种种，探讨工作人数还采取了丁酸与CYP2C9的原子核交接，CYP2C9的几个核苷酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸互为用途，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在应用网络上药学学预估CYP2C9是丁酸会影响CaOx肾结石的靶表观遗传后，探索人士还按照血細胞实验英文声明了CYP2C9可大大减少草酸介导的HK-2血細胞的ROS关卡、真菌感染挫裂伤和凋亡。

图2| 绝对多数据库整合分析一下估计CYP2C9是丁酸功用于CaOx肾结石的靶遗传基因

钻研报告

本研发关键在于显示丁酸在身体外和身上均能抑止CaOx肾结石模式的硫化应激反应反应和细菌感染软组织板材损害，最后一个凭借电脑网络上药学学筛分能够丁酸影响力CaOx肾结石的因素靶点——CYP2C9，最后一个凭借受损神经细胞实验性验证CYP2C9在草酸盐分析的HK-2受损神经细胞ROS质量、细菌感染软组织板材损害和凋亡。这么多显示认为丁酸会凭借抑止CYP2C9来抑止CaOx肾结石的硫化应激反应反应，调低细菌感染软组织板材损害。这类步骤中拜谱动物作为了电脑网络上药学学技能工作，虽然拜谱动物可提升 成熟稳定更加完善的表观遗传组学、核脂肪酸组学、代谢率组学等两组学设备及技能工作，邀请转达了解！ 对比文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.