
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸淡化蛋白酶组学产品,实现1000+举重若轻度表达位点查出,平稳再现精品靶点,全地方生信介绍解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“会发现”到“确认”全程序产品,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、试验程序流程
02、亲测数据报告
03、经“点”显现
在试验数据资料中,检测诸多参考文献中消息的特色靶点简答衣康酸遮盖位点,如一号个被挖掘的衣康酸共价遮盖蛋清KEAP1,同时还有糖酵解通道中的3个最为首要的酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,及炎性小体分解成蛋清NLRP3和细胞核萎缩的过程中的最为首要的蛋清RIPK3等,其质谱图以下图图甲中。
04、货品优点和缺点
1.诸多质控
工产品化特男人查重器孵育、SDS-PAGE查重、WB验正、模板关联性分享等相互位查重,保持建设项目然而准确性性。2.高的性能质谱测试仪器服务平台
在Orbitrap Astral全新这一代高识别质谱仪提升下,达到衣康碱化呈现位点及蛋白酶评定新深层,助推器科学课探究新遇到。3.全流程步骤一走式产品
应用场景拜谱海洋生物建立完善的研究公司,可供应“细胞膜塑造→测试探针孵育→WB论文检测工具→深奥度衣康过酸呈现论文检测工具→独有的生信讲解→不同位点PRM验证通过”全程序流程服务的,省时省劲更省钱。05、介绍游戏内容(地方)
06、适用目标方向
PART 2、文章介绍
论文一
英语怎么说关键词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
中文名字题目:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
深入分析资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
资料二
因为宝贝标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
简体中文题目:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
研究探讨方面:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、经典案例延伸构思
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13包括不强的底物融合力量,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱生物技术衣康硝化作用掩盖组测试数剧数剧中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应体现(如下图所示图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱个人心得体会
是TCA不断循环中的前面分泌转化物,衣康酸调低分泌转化、抗体系统和感染互不之间的互不目的,为方法抗体系统感染性常见发病供给了替代品方法方式。衣康酸构成中的亲电性α,β-不饱合羧酸构成能对营养物质质上的亲水性半胱氨酸残基进行烷基化体现(迈克尔减伤生理反应),这种译员后体现被统称“衣康酸体现(itaconation)”,因此影向营养物质质技能,管控抗体系统回应和分泌转化方式,为多常见发病口服药物新产品研发供给新一个构想。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸体现淀粉酶组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医药学绝一定量靶向治疗代谢率组(QMT1000)或养分新陈产生靶向疗法新陈产生组成品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
基准论文论文参考文献
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.